Entada rheedei Spreng. Image by dineshvalke via iNaturalist

3 de julho de 2024

Informações gerais para a curadoria do checklist de leguminosas

Orientações para verificação de nomes de leguminosas - contribua!

Introdução

Como pesquisadores de leguminosas, todos nós precisamos ter acesso a uma lista precisa de espécies para coletar dados de ocorrência e características de maneira consistente e para curar outros tipos de dados sobre leguminosas (filogenômica, imagens etc.). Por esse motivo, em 2020, iniciamos um projeto para atualizar a lista de nomes da família por meio de um processo contínuo com o objetivo de estabelecer uma lista de checagem, com os nomes aceitos, atualizada e consensual. As informações que coletamos servirão de base para nossa própria pesquisa e a de outros, por exemplo, projetos on-line como o Global Biodiversity Information Facility (GBIF), o Catalogue of Life (CoL) e o World Flora Online (WFO). As correções que fornecemos são totalmente integradas ao portal Plants of the World Online (POWO) de Kew por meio do banco de dados World Checklist of Vascular Plants (WCVP), em colaboração com Rafaël Govaerts, e são sincronizadas com o International Plant Name Index (IPNI). Este documento serve para fornecer um conjunto de instruções que orientará os taxonomistas a fazerem parte dessa iniciativa global.

Etapas

1. Registro

Diga-nos que deseja ajudar enviando os seguintes detalhes ao(s) coordenador(es), conforme listado na Tabela 1:

  • Nome
  • Sobrenome
  • Instituição
  • Cargo
  • País de origem
  • Afiliação institucional (endereço completo)
  • Endereço eletrônico
  • Grupo(s) de leguminosas de interesse

Se mais de uma pessoa estiver disposta a verificar nomes para o mesmo grupo, o coordenador entrará em contato com todos os envolvidos para formar uma equipe.

2. Dados para download

Faça o download da lista de verificação por subfamília e táxons não avaliados no Legume Data Portal. Depois de clicar no link de interesse (abaixo listado), você será direcionado para o GitHub do Legume Data Portal, onde poderá clicar nos três pontinhos à direita do nome do arquivo para fazer o download.

3. Realizando a checagem

Como determinados componentes da lista de checagem já foram verificados, um dos dois processos deve ser seguido daqui para frente: a) verificar os dados pela primeira vez ou b) manter os dados.

A seguir, apresentamos orientações detalhadas para ambos os processos e um fluxograma para ilustrar as etapas.


Figure 1. Flow diagram illustrating the steps that should be followed in checklist curation.

Use dados publicados e siga o Código Internacional de Nomenclatura para algas, fungos e plantas ao checar os dados.

3.1. Primeira checagem

  1. Verifique todos os dados e registre qualquer correção somente na coluna “comentário”.
  2. Para cada registro verificado ou verificado e corrigido, acrescente seu nome completo na coluna “verified by” (verificado por) e a data em que o registro foi realizado na coluna “verified on (date)”.
  3. Quando um nome não aparecer na lista de verificação, visite o site do IPNI, pesquise o nome e, se ele não estiver no banco de dados do IPNI, registre o nome.
  4. É importante destacar na lista de verificação onde são necessárias novas combinações. Nomes não publicados não podem ser incluídos na lista final. Portanto, comente se/quando você pretende publicá-los ou sabe quem publicará esses nomes.
  5. Se tiver conhecimento de uma publicação adicional que justifique o arranjo taxonômico proposto, cite-a na coluna “comentário”. Se você perceber que um artigo com nova sinonímia foi esquecido, basta mencionar o artigo uma vez e não há mais necessidade de fazer alterações detalhadas. Todas as alterações desse artigo serão então adicionadas pelos editores.
  6. Se você questionar a sinonímia, poderá verificar os detalhes em POWO, onde as referências geralmente são fornecidas na seção “Publications” (Publicações) e/ou IPNI.
  7. As categorias de status de nome que podem ser usadas incluem:
    • Aceito
    • Sinônimo
    • Não avaliados
  8. Categorias mais detalhadas que podem ser usadas, se você souber, incluem:
    • Híbrido artificial (tratado da mesma forma que aceito)
    • Ilegítimo (indique se é homônimo ou supérfluo) (tratado como sinônimo)
    • Inválido (tratado como sinônimo)
    • Mal aplicado (sensu auct.) (tratado como sinônimo)
    • Variação ortográfica (tratados como sinônimos)
  9. Envie a lista checada atualizada ao coordenador (Tabela 1) de acordo com instruções fornecidas por ele, com uma cópia do e-mail para Marianne le Roux, Anne Bruneau ou Juliana Rando. Rafaël Govaerts incorporará as correções ao banco de dados do WCVP e entrará em contato diretamente com os taxonomistas se determinadas correções exigirem esclarecimentos.

3.2 Manutenção dos dados

Depois que um determinado nome da lista tiver sido verificado (sinalizado de acordo com a coluna “verificado”), os dados precisarão de uma checagem adicional à medida que os nomes não colocados forem descobertos e incluídos na lista de Fabaceae do WCVP e no Rhakhis, uma ferramenta de edição de nomes on-line que será lentamente integrada aos nossos fluxos de trabalho.

Para nomes não posicionados nas planilhas do Excel, as correções de dados devem ser feitas conforme explicado acima e enviadas ao coordenador do grupo. A manutenção também incluirá a notificação de novas sinonímias ou ressurreição de nomes. Nesses casos, forneça a referência da publicação.

Para nomes não colocados em Rhakhis, faça login na platforma Rhakhis usando o seu ORCID. Instruções escritas e em vídeo sobre como usar o Rhakhis estão disponíveis aqui e um sandbox, se quiser brincar e se familiarizar com o sistema. Se houver nomes não avaliados, eles serão listados na parte inferior da página de cada táxon.

Benefícios de contribuir para a lista consensual de leguminosas

A participação nesta iniciativa será benéfica pelos seguintes motivos:

  • Tornar-se um membro ativo da equipe global de leguminosas
  • Promover sua pesquisa para um público mais amplo
  • Criar sinergia por meio da combinação de pesquisas
  • Aproveitar a pesquisa combinada de outras pesquisadores
  • Receber coautoria por sua contribuição à lista de verificação
  • Tornar-se parte da comunidade global de leguminosas (TEN) que servirá a iniciativas internacionais como WFO, CoL e GBIF

Publicação da lista

  • Catalogue of Life
  • ChecklistBank
  • Global Biodiversity Information Facility
  • Legume Data Portal
  • Plants of the World Online
  • World Flora Online
  • Zenodo (arquivo de todas as versões de listas de verificação publicadas até o momento)

Contatos Em caso de dúvidas, não hesite em entrar em contato com Marianne le Roux, Anne Bruneau e Juliana Rando

Tabela 1. Contact details of coordinators for subfamilies, tribes, clades, or groups.