Compte rendu de la réunion tenue à l’IBC Madrid, le 27 juillet 2024
Les chercheurs sur les légumineuses qui se concentrent sur les Caesalpinioideae (y compris les mimosoïdes) ont récemment publié deux numéros spéciaux de la revue PhytoKeys : Advances in Legume Systematics 14 parties 1 et 2, et ceux-ci fournissent un bon modèle pour s’attaquer aux Papilionoïdes :
- ALS14 partie 1 : Une série d’articles, résolvant principalement les problèmes de non-monophylie de genre mis en évidence par les études de Koenen et al. et Ringelberg et al., qui ont clarifié de nombreux problèmes taxonomiques et nomenclaturaux chez les Caesalpinioideae, en mettant l’accent sur les mimosoïdes Hughes C. et al. (2022) Phytokeys 205: 1-470.
- ALS 14 partie 2 : Une nouvelle classification des Caesalpinioideae, incluant des noms de tribus nouveaux ou rétablis et des noms de clades informels. Bruneau A. et al. (2024) Phytokeys 240: 1-552.
Accord des personnes présentes à l’issue de la réunion :
• Chaque grand groupe de recherche travaillant sur la systématique de niveau supérieur des légumineuses devrait aller de l’avant et publier leurs phylogénies et les implications taxonomiques et nomenclaturales de leurs études.
• Leurs études publiées pourraient/devraient suggérer des clades qui pourraient être considérés pour une reconnaissance tribale formelle, mais ne devraient pas formaliser les noms tribaux ; ceux-ci devraient être convenus par décision collaborative internationale de la communauté des légumineuses. Un objectif important serait d’éviter l’instabilité nomenclaturale.
• La reclassification finale et formelle sera proposée dans une publication de la communauté des légumineuses.
• Bien qu’une nouvelle classification tribale soit de préférence publiée sous l’égide du groupe de travail sur la phylogénie des légumineuses, les détails de la paternité seront discutés et convenus à l’avance, en tenant compte des exigences des différents groupes et individus, lorsque cela est possible.
Prochaines étapes :
Note – nous pouvons organiser des réunions en ligne pour informer les autres si nécessaire.
Le portail des légumineuses du GBIF (et les bases de données associées) peut adopter une classification tribale convenue basée sur Legumes of the World (2005) avec quelques mises à jour dans l’intervalle (car ces portails pourront bientôt inclure les rangs des sous-familles et des tribus).
Au cours de ce processus, plusieurs publications seront probablement nécessaires pour clarifier et nettoyer les problèmes phylogénétiques et taxonomiques (par exemple, la paraphylie et la polyphylie au niveau des genres). Celles-ci pourraient être publiées sous la forme d’un ou de plusieurs numéros spéciaux d’une revue internationale, avant la publication d’une classification formelle des tribus des Papilionoideae, suivant le modèle des parties 1 et 2 de l’ALS 14 pour les Caesalpinioideae.
Toutes les personnes impliquées dans la soumission de ces manuscrits phylogénétiques/phylogénomiques pour publication seront encouragées à agir en tant que réviseurs pour les manuscrits soumis par d’autres groupes de recherche sur les légumineuses et à être coauteurs du document de classification formel final.
Étape 1:
Créer un Groupe de travail sur la phylogénie des tribus de légumineuses pour comparer les phylogénies existantes. Ce groupe sera en grande partie composé de spécialistes moléculaires qui ont produit les arbres phylogénétiques, mais des spécialistes de la taxonomie seront également nécessaires. Vous trouverez ci-dessous une proposition de membres à inclure dans le groupe de travail initial :
Les groupes et les individus intéressés (principalement ceux qui travaillent sur les phylogénies) ont proposé des membres au groupe. Lors de la réunion, les personnes suivantes se sont portées volontaires :
- Rong Zhang & Tingshuan Yi
- Ryan Folk & Carolina Siniscalchi
- Rafaela Trad
- Ashley Egan
Les phylogénies actuelles ou à venir qui devraient être prises en compte sont les suivantes :
- Genomic and enriched (Zhang et al.)
- NITFIX (Folk et al.)
- Angiosperm 353 (Trad et al.)
- Egan et al.
- Bob Jansen and Marty Wojciechowski
Qui d’autre est là ?
Si vous souhaitez rejoindre le Groupe de travail sur la phylogénie des tribus de légumineuses, veuillez contacter Greg Kenicer et Rafaela Trad. Veuillez noter que le groupe de phylogénie est encouragé à consulter une expertise extérieure au cours des processus suivants :
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Identifier et convenir des clades appropriés (ayant le support) pour recevoir des noms tribaux formels. Ceci sera basé en grande partie sur la résolution cohérente des clades qui ont un support fort dans tous les arbres phylogénétiques, étayant ainsi les décisions nomenclaturales finales et la dénomination formelle
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Identifier les taxons/clades nécessitant davantage d’échantillonnage, de vérification des identifications et d’autres problèmes pouvant survenir
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Gérer les désaccords entre les topologies et déterminer comment nommer les grades de taxons dans les phylogénies
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Tenir compte de la diagnostiquabilité (morphologie, chimie, écologie, géographie) et d’autres aspects concernant les tribus proposées. Cela nécessitera une consultation en dehors du groupe central avec des experts en phylogénétique et en taxonomie
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Établir un consensus communautaire sur la classification tribale finale ratifiée par le LPWG et le proposer dans une publication pour permettre à la communauté d’utilisateurs plus large de réagir et de commenter avant que la classification ne soit formalisée
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Une note de prudence a été émise pour faire preuve de prudence lors de la suggestion de noms de clades qui peuvent facilement être latinisés par des groupes travaillant en dehors des légumineuses sans l’expertise nécessaire et qui peuvent publier des noms de manière opportuniste
Étape 2:
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Sur la base de la reclassification tribale proposée par le groupe de travail sur la phylogénie des tribus de légumineuses, ainsi que des commentaires de la communauté taxonomique des légumineuses au sens large et d’autres parties intéressées, présenter un nouveau cadre tribal qui met l’accent sur la stabilité, une large utilité au-delà de la systématique des plantes et vise à être conservateur dans la mesure du possible
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Il faudra pour cela créer un sous-groupe de travail distinct composé de taxonomistes spécialisés (le Groupe de travail taxonomique des tribus de légumineuses) pour coordonner et ratifier la proposition. Si vous souhaitez participer, veuillez envoyer un e-mail à l’adresse ci-dessus.
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Publier officiellement la nouvelle classification consensuelle des tribus de légumineuses (cette classification se concentrant sur les Papilionoideae) approuvée par les communautés internationales de recherche sur les légumineuses et les utilisateurs.